Paberilõikureid on suhteliselt lihtne kasutada ja nende keskkonnanõuded on madalad. Tavaliselt saab neid juhtida tavalisest kontoritoiteallikast. Enamikul paberilõikuritel on automaatne sisse-/väljalülitussüsteem; lihtsalt sisestage paber sisendisse ja lõikur pöörleb automaatselt ja purustab paberi. Mõned paberilõikurid nõuavad käivitusnupu vajutamist, mis seejärel aktiveerib lõikuri ja võimaldab sellel lõikamist jätkata. Pärast purustamist vajutage lõikuri peatamiseks stopp/tagurpidi nuppu.
Enne purustamist kontrollige, kas dokumentidel pole kõvasid esemeid, nagu kirjaklambrid või klambrid. Kui neid leidub, eemaldage need enne paberi söötmispessa sisestamist, kuna need võivad lõiketerasid kahjustada. Paberilõikuri kasutamisel vältige korraga liiga palju paberit, eriti kvaliteetset-paberit, et vältida paberiummistusi. Paberi sisestamisel vältige selle kallutamist ja asetage kitsamad paberilehed söötmisavasse.
Vanemate mudelite puhul vajutage paberiummistuse ilmnemisel purustamise jätkamiseks tagurdus- või stoppnuppu. Enamik paberilõikureid on varustatud ülekoormuskaitseseadmetega, mis lülituvad automaatselt välja, kui mootor ülekoormuse tõttu üle kuumeneb. Sel juhul tuleks masin 20-30 minutiks seisata, et mootor saaks maha jahtuda. Kui kasutate seda uuesti, kaaluge söödetava paberi koguse vähendamist. Täiustatud paberilõikurid peatuvad automaatselt ja laadivad paberi välja, kui need on ülekoormatud, muutes nende kasutamise mugavamaks. Mõned masinad kostavad isegi heli, kui masin on täis, et tuletada kasutajatele meelde paberijääkide eemaldamist.
